「親愛的祖父 你的死亡 不再是家族和國族的禁忌...」
導演廖克發從小與父親疏離,從馬來西亞來到台灣學電影後,帶著攝影機回到家鄉追尋答案。他從生命中缺席的父親,一路追溯到在家族中被視為禁忌話題的祖父,卻發現個人家族歷史的背後,隱藏的竟是馬來西亞一整個世代不願面對的過去,以及一群曾經付出熱血、卻彷彿消失於世間的人們。廖克發的祖父當年加入馬來亞共產黨,年僅29歲就英年早逝。祖母從此絕口不提丈夫,家中連一張祖父的照片都沒有,僅存一張畫像。祖父所加入的馬共,真如課本所說是群恐怖分子嗎?是怎樣的信念,讓祖父毅然決然拋家棄子甚至犧牲生命?為了尋找答案,廖克發卻得踏出馬來西亞,遠赴廣州、香港與泰國邊境,才能找到那群與祖父一樣曾為革命揮灑青春的馬共。二次世戰時日本侵華,珍珠港事變後,在中國受挫的日軍大舉南下大馬,馬來人、華人、印度人等不同族群組成了馬共抗日軍,廖克發的祖父正是其中一員。戰爭結束後,這群對社會公義心懷理想的馬共,轉而以武裝游擊隊對抗英國殖民政府的壓迫不公,從此成了被逮捕的恐怖份子,僥倖沒死的被遣送出境,一生未再踏上馬國土地。
雅克(尚馬巴克爾 飾)與丹佐(尚雷諾 飾)是自小在同一個地區成長,同樣都對潛水與海洋充滿熱愛,一向好勝的丹佐總是把雅克當做敵手,雅克則在一場意外中失去了父親,而遠走他鄉。
長大後,丹佐成了世界潛水冠軍,並重遇沈醉於愛河的雅克與女友喬安娜(羅珊娜艾奎特 飾),與雅克惺惺相惜的丹佐,邀請雅克一同參加潛水極限比賽,兩人展開一場名利、友情與信念的競賽。同時,隨著比賽的進行,雅克一次次突破極限來到深海,每次回來都更加沈溺於深海的幽藍中,喬安娜與雅克則陷入感情冷戰的膠著狀態。
最後,在一場最後的對決中,雅克受了重傷卻仍發了瘋的獨自潛入水中,在深海裡,他看見了一隻海豚.....。